Consejo: es responsable de tomar las decisiones sobre la certificación de la gestión de los establecimientos que participen en el proceso de evaluación externa.

Secretaría Técnica: es la responsable de ejecutar los procesos de evaluación en las instituciones y elaborar los informes técnicos. Cuenta con un equipo de profesionales, expertos en el área de gestión escolar y de evaluación institucional, quienes actúan en el proceso de evaluación externa y calificación del nivel de desarrollo de la gestión, de aquellos establecimientos que postulan a la certificación.

Secretaría de Estudios: es responsable de desarrollar los estudios e investigaciones en el área, que inspiren y potencien la acción de las instituciones escolares en este ámbito.